Dès le début des années 90, germe à l'AFM et à Généthon l'idée d'une « genetic valley » autour de Généthon.
Dès 1994, l'AFM crée une association Evry-Gènes dont l'objectif est d'initier le développement d'un pôle de compétences scientifique et industriel à Evry. Genset est alors la première entreprise à rejoindre le site pour y mener son programme de très grand séquençage. Le transfert à l'Etat des activités de séquençage et de génotypage de Généthon est le véritable point de départ de ce développement : en 1997 et 1998, sont créés à Evry les centres nationaux de séquençage (Génoscope) et de génotypage.
Sous la forte impulsion de l'AFM et en partenariat avec les collectivités locales, Génopôle, dirigé par Pierre Tambourin, prend son essor. Depuis mars 2002, Génopôle est un Groupement d'intérêt public (GIP). L'AFM siège dans les conseils d'administration de Génopôle et de Génopôle Premier Jour. Ce fond d'incubation finance les pré-études de projets avant leur validation par le comité d'experts composé de 13 scientifiques et industriels. Le développement des jeunes sociétés de biotechnologies s'appuie sur un hôtel d'entreprises et un fonds d'aide complémentaire au pré-amorçage (Genopole® 2nd Jour) qui complète l'actuel fonds Genopôle 1er Jour.
A partir de l'expérience menée à Evry, un réseau de Génopôles a été créé dans toute la France (Lille, Marseille, Montpellier, Strasbourg, Toulouse, Rennes-Nantes, Rhône-Alpes)
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