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1991 :
le laboratoire protégé (P3) à l’Institut Gustave Roussy (Villejuif) pour la mise au point de nouveaux vecteurs viraux.

1993 :
le centre d'étude des déficits immunitaires héréditaires et acquis de l'hôpital Necker (C. Griscelli, A. Fischer) qui participe aux premiers essais de thérapie génique menés en France (en particulier le déficit en adénosine déaminase).

1995 :
le réseau GenCell créé par la société Rhône-Poulenc Rorer (RPR) fédérant 14 organismes américains et français (dont Généthon).

1996 :
le Laboratoire de thérapie génique du CHU de Nantes (P. Moullier) – début du financement poursuivi jusqu’à aujourd’hui

1997 :
 l’Institut de Myologie, créé par l’AFM en partenariat avec l’AP-HP et l’Inserm, plateforme de pointe pour la réalisation des essais thérapeutiques où se déroulera entre 2000 et 2002 le premier essai de thérapie génique français pour la dystrophie musculaire de Duchenne. (cf rapport factuel « Institut de Myologie »)

1997 :
-    Généthon, le laboratoire de l’AFM, réoriente ses activités vers la mise au point des techniques de thérapie génique. (cf rapport factuel « Généthon »)
-    le Gene Vector Production Network est créé par l’AFM, en collaboration avec Généthon, le laboratoire de vectorologie de Nantes et l’Institut Paoli-Calmettes de Marseille (cf rapport factuel « vectorologie »).
-     les plateaux d’expérimentation et de production des Ecoles vétérinaires de Maison Alfort et Nantes (centre de Boisbonne) (cf rapport factuel modèles animaux)

1998 :
Début de la collaboration entre Généthon et la Harvard Medical School (Boston, USA) (cf rapport factuel « Collaboration avec la Harvard Medical School »).

2000/2001 :
L’unité de thérapie cellulaire et génique du CHU de Nantes (B. Dreno)

2002 :
l’Institut de la vision (J. Sahel, Paris), travaillant notamment à la mise au point de biothérapies pour les  rétinites pigmentaires ;
-    le centre de thérapies génique et cellulaire pour les maladies de la peau (Nice)

2003 :
Généthon entre dans l’ère des essais sur l’Homme - 4 essais de thérapie génique en préparation  pour des maladies neuromusculaires et un déficit immunitaire.

2005 :
Généthon se dote d’une unité de production de lots de vecteurs pour les essais cliniques, homologuée BPF par l’Afssaps.

2006 :
Généhton délivre son premier lot de vecteurs cliniques pour l’essai gamma-sarcoglycanopathie (lot produit par Harvard, contrôlé par Généthon).